Bu kesintileri iyi bir şekilde öğrenmek istiyorsanız, öncelikle sözleşmenize iyi bir şekilde hakim olmanız gerekir. Buradaki kriterleri göz önüne aldıktan sonra geriye devlet mevzuatından kaynaklanan vergileri vb. kesersiniz. Bu konuda da her bir vergi için ilgili mevzuatını okumanız gerekir.
Örneğin KDV için "Katma Değer Vergisi Genel Uygulama Tebliği":
http://www.gib.gov.tr/fileadmin/user_upload/Tebligler/KDV/kdv_genteb.htm
Sözleşmeden kaynaklı kesintiler haricinde genel olarak şunları kesersiniz, kamu mevzuatından kaynaklanan:
- Gelir Vergisi
- Damga Vergisi
- KDV Tevkifatı
Sözleşmeden kaynaklanacaklara örnek olarak da şunlar sayılabilir:
- Fiyat farkı veriliyorsa, fiyat farkı teminat kesintisi
- Avans verildi ise avansa dair geri ödemeler
- Cezalar...
Yukarıda belirttiğim üzere sözleşmeniz ve sözleşmenizi ilgilendiren mevzuat bunları belirler.